फसल का अवशेष जलाने से निकलने वाला धुआं जहरीली गैसों से भरा होता है, जिससे मानव स्वास्थ्य प्रभावित होता है। वायु प्रदूषण बढ़कर चिंताजनक स्तर तक पहुँच जाता है। फसलों का अवशेष जलाने से मिट्टी की उपरी सतह की लाभ दायक सूक्ष्म जीव नष्ट हो जाते है, जिससे मिट्टी की जैविक सक्रियता घटती है।